Murielle Favre Perret à dirigé la commission de recherche et innovation avec dévotion et enthousiasme durant les 6 ans de son mandat. Elle a initié la première étude suisse sur l'instruction en famille, permettant ainsi de répondre aux questions gouvernementales au sujet de l'instruction en famille (enrôlement sectaire et extrémisme religieux). Elle a également piloté dans ce cadre un travail de gouvernance réflexive très approfondi, se basant sur les travaux de la professeure Christine Brabant, offrant ainsi l'opportunité aux parents IEF du canton de Vaud d'apporter leur avis sur l'aspect législatif qui les concernaient, et qui a été entendu par le département vaudois, ce qui est une première en Suisse !
Ne s'arrêtant pas là, elle s'est tout autant dévoué au développement d'outils qui permettent de mieux accompagner les enfants dans l'épanouissement de leur potentiel, comme le livret de formation pour enfant ainsi que d'autres outils actuellement en cours de développement et en phase de tests.